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杨建华

 个人经历与学术成就:

中山大学“百人计划”人才;

2012年入选广州市“珠江科技新星”计划。

主要从事非编码RNA基因的结构和功能调控网络研究,近年来通过整合多维高通量测序和基因组学数据开发了精确、快速的新软件和新平台(starBaseStarScansnoSeekertRF2CancerChIPBasedeepBaseRMBase等)在人类等模式生物中实现对非编码RNA的结构、靶标组、表观转录组和转录调控网络的研究。发表的多篇研究论文被评为ESI高引用论文和杂志的Top Paper2篇被引用超过200次,1篇研究论文入选2014年“中国百篇最具影响国际学术论文”,1篇文章被选为Cell Res.杂志的封面和亮点文章。开发的生物信息学工具受邀在Springer Humana两个出版社撰写书的章节和受邀为Non-coding RNA journal (MDPI publisher)杂志的编委,是Nucleic Acids Res.Mol. Biol. Evol.BioinformaticsBrief Bioinform. Mol. BioSyst.等生物信息学专业杂志审稿人。

 

近期代表性论文:

[1] Huang ZPDing YChen JWu GKataoka MHu YYang JHLiu JDrakos SGSelzman CHKyselovic JQu LHDos Remedios CGPu WTWang DZ. Long non-coding RNAs link extracellular matrix gene expression to ischemic cardiomyopathy. Cardiovasc Res. 2016 Aug 24. pii: cvw201. [Epub ahead of print]

[2] Zheng LLXu WLLiu SSun WJLi JHWu JYang JHQu LH. tRF2Cancer: A web server to detect tRNA-derived small RNA fragments (tRFs) and their expression in multiple cancers. Nucleic Acids Res. 2016 Jul 8;44(W1):W185-93.

[3] Liu SLi JHWu JZhou KRZhou HYang JHQu LH. StarScan: a web server for scanning small RNA targets from degradome sequencing data. Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1):W480-6.

[4] Zheng LLLi JHWu JSun WJLiu SWang ZLZhou HYang JHQu LH. deepBase v2.0: identification, expression, evolution and function of small RNAs, LncRNAs and circular RNAs from deep-sequencing data. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D196-202.