郑凌伶

目前主要采用高通量转录组技术研究非编码RNA的鉴定及功能问题，包括microRNA、tRNA、snoRNA、长非编码RNA、环状RNA的鉴定、表达、进化和功能分析。建立了目前国际上最全面的非编码RNA数据库deepBase 2.0，并开发了专门从高通量测序数据中挖掘tRNA Fragment的工具，且分析了32种癌症数据中tRF的表达情况。迄今共发表SCI论文14篇，其中第一作者论文7篇，与伦照荣教授合作的病原寄生生物转录组分析的成果发表在国际顶级杂志PNAS上，受到science杂志编辑的点评。此外，主持4项科研项目，其中2项为国家级；参加4项国家级科研项目工作。

近期代表性论文：

[1] Zheng LL, Li JH, Wu J, Sun WJ, Liu S, Wang ZL, Zhou H, Yang JH, Qu LH. deepBase v2.0: identification, expression, evolution and function of small RNAs, LncRNAs and circular RNAs from deep-sequencing data. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D196-202.

[2] Zheng LL, Xu WL, Liu S, Sun WJ, Li JH, Wu J, Yang JH, Qu LH. tRF2Cancer: A web server to detect tRNA-derived small RNA fragments (tRFs) and their expression in multiple cancers. Nucleic Acids Res. 2016 Jul 8;44(W1):W185-93.

[3] Li JH, Liu S, Zheng LL, Wu J, Sun WJ, Wang ZL, Zhou H, Qu LH, Yang JH. Discovery of Protein-lncRNA Interactions by Integrating Large-Scale CLIP-Seq and RNA-Seq Datasets. Front Bioeng Biotechnol. 2015 Jan 14;2:88.

[4] Shao P, Liao JY, Guan DG, Yang JH, Zheng LL, Jing Q, Zhou H, Qu LH. Drastic expression change of transposon-derived piRNA-like RNAs and microRNAs in early stages of chicken embryos implies a role in gastrulation. RNA Biol. 2012 Feb;9(2):212-27.